根据现有信息，中国实行博士申请考核制的大学主要集中在顶尖高校，且多数为985/211工程院校。以下是综合多个来源后的整理：

一、全国重点高校中的考试制博士项目

清华大学

多个学科领域（如工学、理学、医学等）实行申请考核制，强调科研能力和创新潜力。

北京大学

除医学领域外，哲学、文学、历史学等学科采用申请考核制，注重学术成果和综合素质。

南京大学

工学、理学、管理学等学科推行申请考核制，以研究计划和面试为主要评估方式。

复旦大学

国际学术领域（如医学、法学）及部分基础学科采用申请考核制。

上海交通大学

临床医学、口腔医学、材料科学等学科实行申请考核制，综合评估科研与实践能力。

同济大学

工程、建筑、管理学等学科采用申请考核制，注重工程实践与理论结合。

西安交通大学

机械工程、电气工程、材料科学等学科推行申请考核制。

哈尔滨工业大学

工程、材料、计算机等学科采用申请考核制，强调科研创新。

中国农业大学

农业科学、生命科学等学科实行申请考核制，结合田野调查与实验室研究。

对外经贸大学

国际经济、金融、法学等学科采用申请考核制，注重国际化视野。

二、其他实行考试制博士的院校

中山大学 （985）：医学、哲学、法学等学科

华中科技大学 （985）：工学、理学、医学等学科

东南大学 （985）：工学、材料科学等学科

浙江大学 （985）：化学、生物学、工程等学科

中国科学技术大学 （985）：理学、工学、医学等学科

兰州大学 （985）：农学、化学、材料等学科

三、注意事项

考核内容 ：除学术论文外，部分院校还考察科研项目、实习经历、面试表现等；

动态调整 ：部分院校可能根据学科发展调整招生方式，建议通过官网或招生办获取最新信息；

权威性验证 ：建议通过教育部官网、学校官网或权威招生平台（如中国研究生招生信息网）核实最新招生简章。

以上信息综合了近年多所高校的招生政策，部分院校可能在不同学科领域采用差异化的考核方式。