根据近年高校排名和学科评估数据，南京有以下两所大学在综合实力和排名上出现较明显退步：

一、南京工业大学

排名变化

根据ABC排行榜数据，南京工业大学2022年位列第37名，2024年滑落至第38名，2025年进一步降至第41名，四年排名持续下滑。

学科与资源限制

学科布局单一，传统优势学科如化学工程与技术虽仍较强，但新兴学科和跨学科研究不足，难以适应社会需求。

高校合并后管理难度和资源分配压力增加，科研设备更新和人才引进受限。

二、南京财经大学

排名下滑

在2016年财经热时期，南京财经大学录取分数线曾高于多所双一流高校，但近年来学科评估成绩不理想。第四轮学科评估中，应用经济学仅获B级，低于第三轮。

专业与竞争环境变化

随着“财经热”转向“计算机热”，该校在财经类领域的竞争力下降，录取分数线和学科影响力均有所减弱。

其他说明

南京大学 ：虽然未直接提及排名下滑，但作为曾经的“亚洲第一高校”，其综合实力已从1996年的全国第三降至近年来的前十之外，主要因学科拆分和传统优势学科调整。

南京师范大学 ：作为211/双一流高校，其排名相对稳定，未出现显著退步。

建议关注高校官方信息及权威排名平台（如QS、THE）获取最新动态。