北京大学元培学院提供了一系列多样化的专业，旨在为学生提供宽广的学术基础和跨学科的学习机会。学生可以根据自己的兴趣和职业规划选择专业，同时学院也鼓励学生进行跨学科的学习和研究。

自然科学类专业

化学

应用化学

材料化学

化学生物学

物理学

大气与海洋科学

环境科学

环境工程

环境管理

社会科学类专业

心理学

应用心理学

社会学

政治学

国际关系

人文学科类专业

中国文学

汉语语言学

古典文献学

应用语言学

哲学

逻辑学

宗教学

历史学

艺术学

工程技术类专业

计算机科学与技术

软件工程

信息管理与信息系统

自动化

机械设计制造及其自动化

纺织工程

药学

公共事业管理

工程管理

经济学与管理类专业

经济学

工商管理

艺术类专业

音乐学

艺术设计

跨学科与特色专业

混合专业 ：如“政治、经济与哲学”专业、“古生物学”专业（地质和考古的结合）、“外国语与外国历史”专业等。

其他专业

护理学

工程

元培学院的学生在本科阶段可以享受灵活的专业选择权，他们可以在第二年根据自己的兴趣和职业规划选择专业，甚至可以修读两个以上学院的专业课程，以获得更为宽广的学术背景和专业知识。这种教育模式旨在培养学生的综合素质和创新能力，使他们能够适应未来不断变化的职业环境。