南京大学修改章程的原因主要是为了 适应学校发展的需要 。具体来说，有以下几点：

明确学校行使办学自主权的基本规则、决策程序与监督机制 ：章程是依法治校的基本依据，通过修改章程可以进一步明确学校内部的管理体制和运行机制，确保学校各项工作的合法性和规范性。

体现以人为本的办学理念，突出对教师和学生权益、地位的确认与保护 ：章程是传承学校历史传统、体现办学宗旨、彰显教育理念、凝练办学制度的主要载体。修改章程可以使学校的办学理念更加明确，更好地保障教师和学生的权益。

凝聚上下共识、统一全校思想，推动、深化学校的改革与发展 ：通过章程制定过程，可以进一步凝聚学校内部的共识，统一全校思想，从而推动学校的改革与发展。

适应学校发展战略和目标的变化 ：随着学校的发展，其发展战略和目标可能会发生变化。修改章程可以使学校更好地适应这些变化，确保学校各项工作的顺利推进。

履行法定义务，实现学校依法治校、依法自主办学的必然要求 ：修订章程也是履行法定义务，确保学校依法治校、依法自主办学的必然要求。

综上所述，南京大学修改章程是为了更好地适应学校发展的需要，确保学校依法治校、科学发展的各项要求得到落实，同时更好地保障教师和学生的权益，凝聚全校共识，推动学校的改革与发展。