PCR鉴定转基因植株时，设定正对照和负对照是为了确保实验结果的准确性和可靠性。正对照是指已知含有转基因DNA的样品，它的目的是验证PCR反应体系是否正常工作，以及检测方法是否灵敏和特异。正对照应该包含转基因植株的DNA或已知含有转基因DNA的标准品，确保PCR反应可以成功扩增出预期的转基因片段。负对照是指不含有转基因DNA的样品，它的目的是检测PCR反应中是否存在污染或假阳性结果。负对照应该是与待测样品相同的基因型或物种，但不含有转基因DNA。通过对负对照进行PCR反应，如果出现预期的转基因片段扩增，那么说明PCR反应存在污染或假阳性结果。通过设定正对照和负对照，可以确保PCR鉴定转基因植株的结果准确可靠。正对照和负对照的设定是PCR鉴定实验中的常规步骤，能够帮助排除实验误差和结果的不确定性。PCR鉴定转基因植株的方法主要有两种：基于目标基因的PCR和基于转基因特异序列的PCR。基于目标基因的PCR是通过扩增目标基因的特定片段来鉴定转基因植株，而基于转基因特异序列的PCR是通过扩增转基因特异序列来鉴定转基因植株。在进行PCR鉴定转基因植株时，除了设定正对照和负对照外，还需要注意以下几点：

1. 选择适当的引物：引物的设计应该能够特异性地扩增目标基因或转基因特异序列，避免与非目标序列发生非特异性扩增。

2. 优化PCR反应条件：包括反应体系的组成、引物浓度、扩增温度和时间等，以确保PCR反应的灵敏度和特异性。

3. 使用合适的PCR方法：根据实验需要选择适当的PCR方法，如常规PCR、实时定量PCR等。

4. 重复实验：为了验证结果的可靠性，应该进行多次重复实验，并对结果进行统计分析。通过合理设定对照和注意实验细节，PCR鉴定转基因植株的结果将更加可靠和准确，为转基因植物的鉴定和监测提供重要依据。